В момента заплатите на всички депутати се отпускат от техните правителства.
Обикновено заплатите на членовете на ЕП се равняват на тези на депутатите в тяхната страна.

В същото време, съобщава Портал Европа, ЕП покрива следните разходи:

Пътни: (за пътуване до Брюксел и Страсбург, възможно е да се включат и други пътувания по работа), със самолет: цена на билет икономическа класа (след представяне на бордните карти), с кола: 71 евроцента на километър за първите 500 км и 30 цента на км след това, дневни (покриващи разходи за хотел и ресторант; изплащат се само, ако се потвърди присъствие на работа чрез вписване в регистър) - 279 евро на ден, общи разходи (офис материали и др.) - 3946 евро на месец, сума за асистенти (за заплати на асистентите, но само след представянето на договорите) - най-много 15 496 евро на месец (точната сума зависи от това колко асистенти са наети и на каква заплата).

Това е настоящата система за заплащане на депутатите, като през 2009 г. - след изборите, ще влезе в сила нов "Статут за членовете на ЕП", според който всички депутатите ще получават еднакви заплати, които ще се изплащат от Парламента.